迎恩门
据考古调查资料表明，距今2－3万年以前的旧石器时代晚期，齐齐哈尔市境内就已经有人类活动。[3]齐齐哈尔城始建于1125年，1699年（清康熙38年）至1954年作为黑龙江省省城，以「扼四达之要冲、为诸城之都会」的紧要之地闻名，是一座历史底蕴深厚、地域文化纷呈的北疆边陲重镇。[4]
清朝之前
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齐齐哈尔始建城于金朝初。当时齐齐哈尔一带居住着室韦部。天会三年（1125年）二月，金太宗把庞葛城分给乌古、敌烈二部。《东北历代疆域史》和《黑龙江古代简史》均记载庞葛城即今齐齐哈尔。齐齐哈尔古城址位于今日梅里斯区哈拉古城址。
清朝初年，齐齐哈尔地区属于清朝盛京内务府管辖，不久归属宁古塔将军。
1665年，清廷在此设卜奎驿站。
清早期珐琅彩鎏金龙头马蹬，现藏齐齐哈尔博物馆
1674年（康熙十三年），清政府为抗击沙俄入侵，移吉林水师驻齐齐哈尔现齐齐哈屯。
1683年（康熙二十二年），定齐齐哈尔为水师营制，隶属黑龍江將軍衙门，次年又设火器营。
1691年（康熙三十年），为了进一步加强防卫，建齐齐哈尔城，是为齐齐哈尔新城。
1699年（康熙三十八年），设黑龙江将军衙门由墨尔根城迁于此，从此，齐齐哈尔成为黑龙江近300年来的政治、经济、军事、文化中心。“扼四达之要冲，为诸城之都会”。
1905年（光绪三十一年），置黑水厅。
1907年（光绪三十三年），黑水厅升为龙江府，设知府。同年废黑龙江将军，改建黑龙江省，齐齐哈尔为省会。
近代时期
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中華民國大陸時期（1911－1949年），齐齐哈尔一直作为黑龍江省省会。
1924年，黑龙江省成立黑龙江省城市政公所，管理齐齐哈尔市事宜。
1929年，黑龙江省城市政公所改为黑龙江省城兼商埠市政局，主管黑龙江省城齐齐哈尔及商埠界内市政诸事，隶属于黑龙江省政府。
1931年11月4日，日军进攻嫩江江桥，黑龙江省代主席马占山指挥中国守军抵抗。随着日军援军的到来，马占山被迫撤退。11月19日，日军占领齐齐哈尔。满洲国成立后，设立龙江省，齐齐哈尔为省会。
1936年，建立齐齐哈尔市公署，隶属龙江省公署。此为齐齐哈尔设市之始升为齐齐哈尔市。
1945年－1949年，齊齊哈爾市為嫩江省省會
1945－1949年，曾为嫩江省、黑嫩省省会。[5]解放后，齐齐哈尔成为新的嫩江省省会。中国内战中，林彪命许英年率军占领齐齐哈尔，后许英年转任齐齐哈尔地委书记。
中华人民共和国时期
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1949-1954年为黑龙江省省会。
1954年，黑龙江省会迁往哈尔滨，齐齐哈尔成为省辖市。
1958年，齐齐哈尔划归嫩江专区专员公署管辖。
1960年，国务院撤销嫩江专区，嫩江专区所辖各县划归齐齐哈尔市领导，始行市管县体制，齐齐哈尔市复为省辖市。
1961年，国务院恢复嫩江地区专员公署，齐齐哈尔市及所辖各县归嫩江地区管辖。
1964年，齐齐哈尔市复为省辖市。
1967年，齐齐哈尔市革命委员会成立，撤销齐齐哈尔市人民委员会。
1980年，齐齐哈尔市革命委员会改称齐齐哈尔市人民政府。
1983年，被国务院批准为具有独立立法权的较大的市。
1985年，推行“地市合并”，嫩江地区行政公署与齐齐哈尔市合并，再次实行市管县体制，齐齐哈尔市仍为省辖市。